Лаборатории кафедры биохимии и биотехнологии

О кафедре | Сотрудники | Студентам | Лаборатории

 

Laboratory of Molecular Biotechnology

Head: Kuluev Bulat, Ph.D.
 
Objects of study
Hairy root cultures of medicinal plants;
Hairy root cultures producing recombinant proteins and peptides;
Hairy root cultures producing metabolites for green chemistry;
Creation of bioreactors for the commercial cultivation of hairy roots;
Making of transgenic plants with economically valuable traits.
 
 
 
 
Equipment
Autoclaves
Thermostats 
Orbital shakers
Drying ovens
Laminar flow boxes
Centrifuges
DNA-thermocycler
Equipment for gel electrophoresis
 
 
 
 
 

Группа иммунобиотехнологических подходов изучения растений

Руководитель – проф. С.Ю. Веселов

Персональный состав

к.б.н. Архипова Татьяна Николаевна

к.б.н. Ахиярова Гузель Рифовна

д.б.н. Высоцкая Лидия Борисовна

к.б.н. Коробова Алла Владимировна

к.б.н. Тимергалина Лейля Назировна

к.б.н. Шарипова Гузяль Вакильевна

студентка магистратуры Ахтямова Зарина.

студентка магистратуры Мухарямова Айгуль

студентка бакалавриата Абсалямова Гульнас

 

Направление работы

1.​ Изучение особенностей гормональной системы мутантных растений арабидопсиса.

2.​ Изучение влияния бактерий, продуцирующих гормоны растений, на устойчивость растений пшеницы к засухе.

3.​ Исследования водных каналов аквапоринов ячменя (совместно с университетом г. Окаямы, Япония).

4.​ Исследования белка транспортера липидов (ЛТБ) совместно с Институтом биоорганической химии им. Овчинникова

 

Решаемые задачи

(а) Оценка роли трансцептора NRT1 в регуляции уровня цитокининов у растений на модели мутанта Сhl1-5 по гену трансцептора нитратов (NRT1)

(б) Проверка предполагаемой роли переносчика нитратов NRT2в качестве переносчика АБК.

(в) Выявление роли гормонов в регуляции уровня аквапорирнов и гидравлической проводимости растений.

(г) Выявление участия липид транспоритирующих белков в регуляции формирования поясков Каспари.

Методы и оборудование

Основной метод исследований – иммунобиотехнология с использованием антител к белкам и гаптенам (фитогормонам) для их количественного определения и иммуногистохимиской локализации в клетках растений. База проводимых исследований – лаборатория физиологии растений, Уфимского института биологии, РАН.

 

Оборудование

Климатическая камера для поддержания условий для роста растений (влажность, освещенность, температуры) SANYO, MLR-351H (Япония).

Микрофотометр для регистрации результатов иммуноанализа гормонов "Униплан", Россия).

Портативный порометр для определения устьичной проводимости (Mk3, Delta-T Devices, UK ).

Психрометр Wescor-PSYPRO пр-ва WescorEnvironmental Products.

Осмометр Digital Micro-Osmometer пр-ва CAMLAB Limitedу.

Ротационный микротом НМ 325 (MICROM Laborgerate GmbH, Германия).

Световые микроскопы Jenamed-2 (Carl Zeiss, Germany), Axioscop 40 с программным обеспечением для анализа изображения (базовая программа AxioVision Release 4.8) (Carl Zeiss, Germany).

 

Гранты и публикации

Грант РФФИ 13-04-00666 А «Роль трансмембранного переноса в ксилемном и флоэмном транспорте и формировании градиентов концентрации цитокининов в тканях растений» Руководитель – проф. С.Ю. Веселов

Наиболее существенные публикации за последние 5 лет:

1.​ Lidiya B. Vysotskaya, Stanislav Yu. Veselov, Guzel R. Kudoyarova. Effect of Competition and Treatment with Inhibitor of Ethylene Perception on Growth and Hormone Content of Lettuce Plants // Journal of Plant Growth Regulation. - 2017. – V. – 36. Р. 450–459. (WOS)

2.​ Korobova A. V., Vysotskaya L. B., Vasinskaya A. N., Kuluev B., Veselov S.Yu, Kudoyarova G.R. Dependence of root biomass accumulation on the content and metabolism of cytokinins in ethylene-insensitive plants // Russian Journal of Plant Physiology. - 2016. - V. 63 -. Р. 597-603. (WOS)

3.​ Seldimirova O.A., Kudoyarova G.R., Kruglova N.N., Zaytsev D. Yu, Veselev S.Yu. Changes in distribution of cytokinins and auxins in cells during callus induction and organogenesis in vitro in immature embryo culture of wheat // In Vitro Cellular and Developmental Biology - Plant. - 2016. – V. – 52. – Р. 251–264. (WOS)

4.​ Sharipova G. , Veselov D., Kudsoyarova G., Fricke W., Dodd I., Katsuhara M., Furuichi T., Ivanov I., Veselov S. Exogenous application of abscisic acid (ABA) increases root and cell hydraulic conductivity and abundance of some aquaporin isoforms in the ABA deficient barley mutant Az34 // Annals of Botany. - 2016. V. 118. – P. 777-785 (WOS)

5.​ Veselov D.S., Sharipova G.V., Veselov S.Yu, Dodd I.C., Ivanov I., Kudoyarova G.R. Rapid changes in root HvPIP2;2 aquaporins abundance and ABA concentration are required to enhance root hydraulic conductivity and maintain leaf water potential in response to increased evaporative demand // Functional Plant Biology. - 2016. -doi.org/10.1071/FP16242 (WOS)

6.​ Иванов И.И., Трапезников В.К., Веселов С.Ю., Фархутдинов Р.Г., Кудоярова Г.Р. Системная реакция растений на локальное воздействие минерального питания. Уфа: РИЦ БашГУ, 2015. 236 с.

7.​ Kudoyarova G.R., Dodd I.C., Veselov D.S., Rothwell S.A., Veselov S.Y. Common and specific responses to availability of mineral nutrients and water // Journal of Experimental Botany. - 2015. - V. 66. - P. 2133-2144. (WOS)

8.​ Yu. Shtratnikova V.Yu., Kudryakova N.V., Kudoyarova G.R., Korobova A.V., Akhiyarova G.R., Danilova M.N., Kusnetsov V.V, Kulaeva O.N. Effects of nitrate and ammonium on growth of Arabidopsis thaliana plants transformed with the ARR5::GUS construct and a role for cytokinins in suppression of disturbances induced by the presence of ammonium // Russian Journal of Plant Physiology. - 2015. - V. 62. - P. 741–752. (WOS)

9.​ Arkhipova T.N., Vysotskaya L.B., Martinenko E.V., Ivanov I.I., G. R. Kudoyarova G.R. Participation of cytokinins in plant response to competitors // Russian Journal of Plant Physiology. - 2015. - V. 62. - Р. 524–533. (WOS)

10.​ Vysotskaya  L. B., Akhiyarova  G. R. ,  Sharipova G. V., Veselov  S. Yu. The influence of local IPT gene induction in roots on content of cytokinins in cells of tobacco leaves // Cell Tissue Biol. - 2015. -  V. 9. - Р. 127-132 (Scopus). 

11.​ Высоцкая Л.Б., Веселов Д.С., Фархутдинов Р.Г., Веселов С.Ю. Гормональная регуляция водного обмена и роста растений на разных фонах минерального питания и при дефиците воды. Уфа: РИЦ БашГУ, 2014. С. 244. ISBN 978-5-7477-3666-5

12.​ Kudoyarova G.R., Alexander I. Melentiev A.I., Martynenko E.V., Arkhipova T.N., Galina V. Shendel G.V., Kuz'mina L.Yu., Dodd I.C., Veselov S.Yu. Cytokinin producing bacteria stimulate amino acid deposition by wheat roots // Plant Physiology and Biochemistry. – 2014. – V. 83. – P. 285–291. (WOS, Scopus)

13.​ Kudoyarova G.R., Korobova A.V., Akhiyarova G.R., Arkhipova T.N., Zaytsev D.Yu, Prinsen E., Egutkin N.L., Medvedev S.S. , Veselov S.Yu. 2014. Accumulation of cytokinins in roots and their export to the shoots of durum wheat plants treated with the protonophore carbonyl cyanide m-chlorophenylhydrazone (CCCP) // Journal of Experimental Botany. – 2014. V. 65, № 9. – Р. 2287-2294. (WOS, Scopus)

14.​ Кудоярова Г.Р., Веселов Д.С., Шарипова Г.В., Ахиярова Г.Р., Dodd I.C., Веселов С.Ю. Водный обмен и рост исходных и дефицитных по АБК мутантных растений ячменя при повышении температуры воздуха // Физиология растений - 2014. – Т. 61, № 2. - С. 207–213. (WOS, Scopus)

15.​ Высоцкая Л.Б., Ахиярова Г.Р., Шарипова Г.В., Дедова М.А., Веселов С.Ю., Зайцев Д.Ю., Кудоярова Г.Р. Влияние локальной индукции ipt-гена в корнях на содержание цитокининов в клетках листьев табака // Цитология 2014, Т. 56, С. 816-821. (Scopus).

16.​ Дедова М. А., Высоцкая Л. Б., Кудоярова Г. Р., Веселов С. Ю. Влияние вторично активного транспорта на содержание цитокининов в побегах и корнях растений пшеницы в норме и после действия теплового шока // Вестник БашГУ. – 2014. - Т. 19. № 2 - С. 449-452.

17.​ Коробова А.В., Васинская А.Н., Ахиярова Г.Р., Веселов С.Ю., Кудоярова Г.Р., Hartung W. Зависимость распределения цитокининов в растениях от скорости транспирации // Физиология растений. 2013. Т. 60. С. 184-191.

 

 

 

Группа медицинской биохимии и биотехнологии

Руководитель: д.б.н. Гарипова Маргарита Ивановна

Персональный состав: Дацко Олеся Ильдусовна (аспирант), Гималетдинова Гулюса Сабирьяновна (аспирант), Данилова Юлия Сергеевна (магистрант), Абдрахимова Айгуль Ринатовна (магистрант)

 

Направление работы

  1. Исследование полиэндокринных и метаболических нарушений, сопутствующих сахарному диабету;

  2. Разработка методов получения и определения эндокринной активности пептидов, образующихся из белков – прогормонов млекопитающих и человека;

  3. Изучение механизмов транспорта гидрофобных гормонов.

 

Решаемые задачи

  1. Изучение нарушений функции щитовидной железы, сопутствующих сахарному диабету.

  2. Изучение нарушений продукции половых гормонов при сахарном диабете.

  3. Разработка методов получения, очистки и определения биологической активности пептидов с гипогликемическим действием.

  4. Разработка методов получения, очистки и определения биологической активности пептидов, влияющих на липидный состав плазмы крови.

  5. Изучение распределений тиреоидных и стероидных гормонов между плазмой крови, эритроцитами и ядрами чувствительных клеток разной тканевой принадлежности.

 

Методы и оборудование

  1. Методы молекулярно-ситовой, ионообменной и аффинной хроматографии;

  2. Иммуноферментный анализ;

  3. Методы клинической биохимии

 

Патенты

  1. Способ получения иммобилизованных белков (Авторское свидетельство) -1989 г;

  2. Способ получения носителя для иммобилизации аминосодержащих соединений (Авторское свидетельство)-1992 г;

  3. Сшитый поливиниловый спирт с иммобилизованной м-аминофенилбороновой кислотой в качестве сорбента для аффинного определения гликозилированного гемоглобина (Патент на изобретение) - 1996 г;

  4. Пористый силикагель, модифицированный глицерилпропилсиланом и эпихлоргидрином с иммобилизованной мета- аминофенилбороновой кислотой в качестве сорбента для аффинного определения гликозилированного гемоглобина (Патент на изобретение)-2004 г;

  5. Способ определения концентрации катионов цинка в сыворотке крови с одновременным определением соотношения катионов цинка и меди в той же пробе (Патент на изобретение) – 2015 г.

 

 

Лаборатория микробиологии и экологической биотехнологии

Григориади А.С. (к.б.н., доцент), Залилова Л.Р. (маг.), Арсланова А.Г. (маг.), Мустахитдинова З.Р. (бак.), Мухаметдинова Н.Н.(бак.), Фаррахова А.Р. (бак).

 

Биологическая рекультивация нефтезагрязненных почв

В рамках данного направления провидится апробация различных методов ремедиации нефтезагрязненных земель, в том числе и использованием микробных препаратов и растений-фитомелиорантов. Проводятся работы по выделению и характеристики чистых культур и консорциумов углеводородокисляющих микроорганизмов с перспективой использования их для очистки и восстановлений загрязненных почвенных экосистем. Также осуществляется разработка и апробация подхода биостимуляции in vitro нефтезагрязненных почв (биостимуляция образцов естественной микрофлоры загрязненной почвы/грунта проводится сначала в лабораторных условиях, обеспечивая избирательный рост тех микроорганизмов, которые способны наиболее эффективно утилизировать данный загрязнитель, а затем «активизированную» микробиоиту вносят в загрязненный объект одновременно с необходимыми добавками, повышающими эффективность утилизации загрязнителя).

 

Растительно-микробные взаимодействия в условиях техногенного загрязнения

Направление ориентировано на изучение влияния техногенного загрязнения на физиолого-биохимические параметры растений, а также на оценку устойчивости растений к действию поллютантов. Также проводятся исследования влияния ризосферной микробиоты на интенсивность разложения нефтяных углеводородов и выявления видов растений, под посевами которых происходит максимальное разложение поллютантов. По полученным результатам будут предложены рекомендации по использованию технологии фиторемедиации почв, загрязненных нефтью, а также отходами нефтеперерабатывающей и нефтедобывающей промышленности в условиях умеренных широт.

 

Микробиологический и микологический мониторинг нарушенных почв

В рамках данного направления проводится оценка эколого-биохимического состояния почв, загрязненных продуктами и отходами нефтедобывающей и нефтеперерабатывающей промышленности. В качестве объектов исследования используются различные типы почв, характерные для разных климатических зон России. Детально изучается влияния загрязнителей на биологические показатели почвы по изменению количественного и качественного состава почвенных микроорганизмов, ферментативной активности. Большое внимание уделяется изучению сообщества микроскопических грибов в почве, так как в результате загрязнения увеличивается доля фототоксичных и оппортунистических видов. Разрабатываются интегральные показателей биологической активности почв для всесторонней оценки состояния почвы.

 

Методы и оборудование

Для выполнения проекта будет применяться комплекс технологий микробиологических исследований, а также биохимические, агрохимические методы. Ферментативная активность будет определяться газометричеким и колориметрическим методами. Количественный и качественный учет различных групп микроорганизмов проводится по стандартной методике с использованием современных материалов и аппаратуры. При оценке влияния поллютантов на растения, помимо базовых показателей, таких как содержание пигментов, витаминов и некоторых ферментов, проводится исследование корневой системы и ее микоризации с использованием люминесцентного микроскопа ЛОМО Микромед-2 (Россия).

 

Публикации

Киреева Н.А., Новоселова Е.И., Шамаева А.А., Григориади А.С. Биологическая активность чернозема выщелоченного, загрязненного продуктами сгорания попутного нефтяного газа, и возможности ее восстановления при фиторемедиации // Почвоведение. – 2009. – №4. – С. 498-503.

Баширова Р.М., Григориади А. С., Киреева Н.А., Юмагужин М.С., Тимербаева Г.Р., Долотовская Л.З. Влияние загрязнения почвы нефтью на некоторые физиологические показатели дягиля лекарственного Archangelica officinalis // Аграрная Россия. – 2009. – №2. – С. 42-44.

Киреева Н.А., Рафикова Г.Ф., Григориади А.С., Галимзянова Н.Ф., Логинов О.Н. Влияние биопрепарата Азолен на комплекс микромицетов нефтезагрязненной серой лесной почвы // Микология и фитопатология. – 2009. – №2. – С. 142-150.

Киреева Н.А., Новоселова Е.И., Григориади А.С. Влияние загрязнения почв нефтью на некоторые физиологические показатели растений и ризосферную микробиоту // Агрохимия. – 2009. – №7. – С. 71-80.

Киреева Н.А., Климина И.П., Григориади А.С., Якупова А.Б. Микромицеты как биодеструкторы углеводородов и потенциальные возбудители микозов в нефтезагрязненных регионах // Проблемы медицинской микологии. – 2009. – №2. – С. 79.

Киреева Н.А., Дубовик И.Е., Григориади А.С., Кабиров Т.Р. Оценка фитотоксичности нарушенных почв по показателям альгомикологического комплекса // Агрохимия. – 2009. – №11. – С. 43-49.

Киреева Н.А., Кабиров Т.Р., Григориади А.С., Онегова Т.С. Детоксикация нефтешлама с использованием целлюлозосодержащих субстратов. – Вестник БашГУ, 2008 – Т.13, №1. – С. 47-51.

Киреева Н.А., Шамаева А.А., Григориади А.С., Новоселова Е.И. Изучение возможности утилизации отходов деревопереработки для биологической очистки и детоксикации нефтешламов // Теоретическая и прикладная экология. – 2008. – №3. – С. 81-85.

Киреева Н.А., Шамаева А.А., Григориади А.С., Водопьянов В.В., Новоселова Е.И. Биоремедиация и детоксикация нефтешлама // Защита окружающей среды в нефтегазовом комплексе. – 2009. – №3. – С. 43-47.

Киреева Н.А., Григориади А.С., Хайбуллина Е.Ф. Ассоциации углеводородокисляющих микроорганизмов для биоремедиации нефтезагрязненных почв // Вестник БашГУ, 2009. – Т. 14, №2. – С. 391-394.

Киреева Н.А., Рафикова Г.Ф., Галимзянова Н.Ф., Логинов О.Н., Григориади А.С., Якупова А.Б. Влияние биофунгицида Елена на комплексы микромицетов нефтезагрязненных почв различных типов при биоремедиаци // Микология и фитопатология. – 2010. – Т. 44, Вып. 1. – С. 53-62.

Киреева Н.А., Григориади А.С., Водопьянов В.В., Амирова А.Р. Подбор растений для фиторемедиации почв, загрязненных нефтяными углеводородами // Известия Самарского научного центра Российской академии наук. 2011. Т. 13, № 5(2). С. 184-187.

Баширова Р.М., Григориади А.С., Киреева Н.А., Борисова Н.С., Зимин Ю.С. Устойчивость дягиля лекарственного к загрязнению почвы сырой нефтью // Физиология растений. 2012. Т. 59. № 5. С. 710-715

Григориади А.С., Амирова А.Р., Лопатин Н.В. Оценка эффективности посевов различных фиторемедиантов для восстановления нефтезагрязненной серой лесной почвы // Известия Самарского научного центра Российской академии наук. 2013. Т. 15, № 3 (5). С. 1266-1269

Григориади А.С. Влияние нефтяного загрязнения на сообщества микромицетов серой лесной почвы и проблемы биобезопасности территорий нефтедобывающих предприятий //Успехи медицинской микологии. 2014; Том 12. - С. 104.

Григориади А.С. Использование отходов промышленности для рекультивации нефтезагрязненных почв //IV Международная Научная Экологическая Конференция на тему: «Проблемы рекультивации отходов быта, промышленного и сельскохозяйственного производства». – Краснодар. – Кубанский госагроуниверситет, 2015. – Ч. II. – C. 486-490.

Галимзянова Н.Ф., Киреева Н.А., Бакаева М.Д., Григориади А.С., Рафикова Г.Ф. Грибы рода Aspergillus в основных типах почв Башкортостана // Вестник БашГУ. – Том 20, № 1. - 2015. – С. 115-118. Григориади А.С., Амирова А.Р. Биоиндикация как метод оценки экологической безопасности нефтезагрязненных и рекультивированных почв // Сборник докладов VI Научно-технической конференции молодых специалистов ООО «БашНИПИнефть». г.Уфа 19-22 апреля 2016 г. С. 164-165.

 

 

 

Лаборатория энзимологии

Проф. Ибрагимов Р.И., проф. Яруллина Л.Г., доц. Шпирная И.А., доц. Цветков В.О., магистранты Батырова Э.Р., Максутова В.О., Шляпникова С.В.

 

Молекулярные механизмы адаптации (проф. Ибрагимов Р.И., проф. Яруллина Л.Г., доц. Шпирная И.А., доц. Цветков В.О.)

В рамках данного направления проводится исследование молекулярных компонентов системы «гидролазы патогенов – защитные белки растений», а также разрабатываются экспресс-методы диагностики устойчивости растений для использования в селекции.

Наиболее значимые результаты: разработаны методы определения активности гидролаз и ингибиторов гидролаз; выявлена положительная корреляция между активностью ингибиторов гидролаз в тканях растений и параметрами их устойчивости к биотическому стрессу; показана возможность искусственной регуляции уровня антигидролитической активности в тканях путем обработки растений биологически-активными соединениями; проведено выделение гидролаз насекомых и их ингибиторов на специфических субстратах.

 

Исследование биотехнологического потенциала ксилотрофных базидиомицетов (доц. Шпирная И.А., магистранты Батырова Э.Р., Шляпникова С.В.)

Направление ориентировано на создание коллекции штаммов ксилотрофных базидиомицетов, распространенных на территории Республики Башкортостан, изучение их физиолого-биохимического и биотехнологического потенциала при культивировании на различных субстратах.

Поддерживаются в культуре природные изоляты трутовых грибов – Laetiporus sulphureus, Inonotus obliquus, Polyporus squamosus. Проведены исследования молокосвертывающей активности ксилотрофных базидиомицетов. В водных и органических экстрактах плодовых тел трутовиков впервые идентифицирован ряд соединений.

 

Физико-химические и математические методы. Проект «Экспресс-тест-система на основе биосенсоров для определения содержания антибиотиков в продуктах пчеловодства» (доц. Цветков В.О., магистрант Максутова В.О.)

В рамках данного направления поставлены, модифицированы или разработаны методы и техники определения активности амилолитических и протеолитических ферментов по гидролизу субстрата, иммобилизованного в полиакриламидном геле, поставлены методы электрофореза в иммобилизованном субстрате. Показана возможность количественного определения гидролитической активности и молекулярного состава ферментов данными методами, на основе полученных математических моделей разработаны компьютерные программы для измерения ферментативной активности. В настоящее время проводится исследование структуры и биохимии микробных ферментов с целью создания биосенсорной тест-системы.

 

Методы и оборудование

Для выделения ферментов и белковых ингибиторов используется жидкостная хроматография низкого давления с применением модифицированных аффинных сорбентов. Разделение белков проводится методами изоэлектрического фокусирования, двумерного электрофореза, других хроматографических и электрофоретических методов. Для определения ферментативной и ингибиторной активности используются модифицированные, а также разработанные в лаборатории методы и техники.

Оборудование для исследований: жидкостный хроматограф низкого давления, спектрофотометр Specord-50, установка для изоэлектрического фокусирования белков BioRad Protean IEF, вакуумный лиофильный концентратор, орбитальный шейкер-инкубатор BioSan ES20/60, центрифуга Eppendorf 2417R, комплекс оборудования для очистки, разделения и определения активности ферментов.

 

Публикации и патенты

R.I. Ibragimov, I.S. Mardanshin, G.V. Benkovskaya, M.B. Udalov, I. А. Shpirnaya and V. O. Tsvetkov. Hydrolytic Enzyme Inhibitors and Necrotic Reactions in Potato Leaves Reduce Reproductive Success of Сolorado Potato Beetle.//Journal of Agricultural Science and Technology, 2014, № 4  Р. 331-341

Ibragimov R.I., Tsvetkov V.O., Shpirnaya I.A., Valiakhmetova K.I., Yarullina L.G., Mardanshin I.S.  CHARACTERIZATION OF PROTEINASES OF THE COLORADO POTATO BEETLE AND THEIR INHIBITORS FROM SOLANACEAE PLANTS //Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences. 2015. Т. 6. № 5. С. 405-411.

Яруллина Л. Г., Касимова Р. И., Ибрагимов Р.И., Ахатова А. Р., Умаров И. А., Максимов И. В. Качественные и количественные изменения протеома клубней картофеля под воздействием сигнальных молекул и инфицирования Phytophthora infestans // Прикладная биохимия и микробиолгия. 2016. Т. 52. № 1. С. 85-93.

Сравнительная оценка транскрипционной активности генов защитных белков у разных сортов пшеницы в связи с устойчивостью к Septoria nodorum Berk. Яруллина Л.Г., Касимова Р.И., Ахатова А.Р. Прикладная биохимия и микробиология. 2014. Т.50, №6. С. 599 – 603.

Качественные и количественные изменения протеома клубней картофеля под воздействием сигнальных молекул и инфицирования Phytophthora infestans. Яруллина Л.Г., Касимова Р. И., Ибрагимов Р.И., Умаров И. А., Максимов И. В. Прикладная биохимия и микробиология. 2016. Т. 52. № 1. С. 85-93.

Chitooligosacharides with different degrees of acetylation on the activity of protective proteins in wheat leaves during infection with Septoria pathogen influence. Yarullina L.G., Kasimova R.I., Ibragimov R.I., Tsvetkov V.O., Akhatova A.R., Yarullina L.M., Maksimov I.V. Research Journal of Pharmaceutical Biological and Chemical Sciences, 2016, No 7(5). P. 757-763.

Physico-chemical characterization of amylases of L. decemlineata and their inhibitors from plants Vyacheslav O. Tsvetkov, Irina A. Shpirnaya, Karina I. Valiakhmetova and Rinat I. Ibragimov. Journal of biomolecular structure and dynamics, 2015, V. 33, No sup1, pp 109-110.

Characterization of proteinases of the Colorado potato beetle and their inhibitors from solanaceae plants. Ibragimov, R. I., Tsvetkov, V.O. , Shpirnaya I.A., Mardanshin I.S., Valiakhmetova K.I., Yarullina L.G. Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences, 2015, No 6(5), pp. 405-411.

Яхин О.И., Лубянов А.А., Калимуллина З.Ф., Яхин И.А., Батраев Р.А., Рябцева Н.Д., Шпирная И.А., Ибрагимов Р.И. Влияние биостимулятора Стифун на активность гидролитических ферментов и их ингибиторов в растениях пшеницы при действии абиотических стрессовых факторов Агрохимия. 2017. № 9. С. 63-74.

Молокосвертывающая активность ферментов базидиальных грибов. Шпирная И.А., Шляпникова С.В., Цветков В.О., Ибрагимов Р.И. Доклады Башкирского университета. 2016. Т. 1. № 1. С. 63.

Shpirnaya, I.A., Umarov, I.A., Shevchenko, N.D.,Ibragimov, R.I. Evaluation of the activity of hydrolases and their inhibitors using substrates immobilized on agarose gel // Applied Biochemistry and Microbiology. 2009. № 45 (4), pp. 449-453.

Сервис просмотра и анализа структуры биомолекул. Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2016615885 от 01 июня 2016 г. В.О. Цветков,  И.А. Шпирная, Р.И. Ибрагимов. http://софт.биоуфа.рф/молекулы

Программа для ЭВМ «Инструмент количественной оценки активности амилолитических ферментов и ингибиторов амилаз по площади зоны гидролизованного крахмала, иммобилизованного в гель агарозы». Ибрагимов Р.И., Фазлытдинов М.Ф., Цветков В.О., Шпирная И.А. № госрегистрации 2015612790 от 26.02.2015 г.

Программа для ЭВМ «Инструмент определения ферментативной активности по интенсивности пятен на зимограммах». Ибрагимов Р.И., Цветков В.О., Шпирная И.А. № госрегистрации 2015661375 от 26.10.2015 г.

 

 

 

Лаборатория экологии пчелиных семей и оценки качества продуктов пчеловодства

Руководитель д.б.н. Фархутдинов Р.Г.

 

Мониторинг и кадастровая оценка медоносных ресурсов Республики Башкортостан

(д.б.н. Фархутдинов Р.Г., д.б.н. Хисамов Р.Р. (БГАУ), Кулуев Б.Р.)

Основные направления исследований:

  1. Исследование медоносных ресурсов в различных ботанико-географических зонах Республики Башкортостан.

  2. Изучение влияния различных экологических факторов на нектаропродуктивность основных медоносных растений РБ.

  3. Кадастровая оценка медоносных ресурсов РБ.

  4. Изучение популяций липы мелколиственной Tilia cordata Mill. в РБ, поиск, генотипирование, размножение in vitro лип с повышенной продукцией нектара. Оценка нектаропродуктивности отдельных популяций липы и физиолого-биохимических механизмов регуляции нектаропродуктивности. 

Наиболее значимые результаты: разработаны методика определения кадастровой оценки медоносных ресурсов территорий, проведена оценка медоносных ресурсов горно-лесной зоны РБ, территории Бугульминско-Белебеевской возвышенности, Уфимского плато, Северо-восточной лесостепи.

 

Экологической генетики пчел и продуктов пчеловодства

(д.б.н. Фархутдинов Р.Г., д.б.н. Ильясов Р.А. (ИБГ УНЦ РАН)

Основные направления исследований:

  1. Анализ присутствия пыльцы ГМ растений в продуктах пчеловодства на основе оценки присутствия маркеров ГМ растений в ДНК, выделенной из пыльцы растений, входящих в состав продуктов пчеловодства.

  2. Оценка влияния уровня интрогрессии южных генов в популяции аборигенной пчелы Республики Башкортостан на основе анализа ядерных и митохондриальных генетических маркеров на таксономическое разнообразие пыльценосов и нектароносов, характерных для Южного Урала.

  3. Оценка зависимости генетической структуры аборигенной популяции темной лесной пчелы на территории Республики Башкортостан от экологического состояния условий среды обитания на основе анализа информативных ядерных и митохондриальных генетических маркеров.

 

Разработка фитопрепаратов для профилактики и лечения болезней пчел

(д.б.н. Фархутдинов Р.Г., д.б.н. Юмагужин Ф.Г. (БГАУ), д.б.н. Туктаров В.Р. (БГАУ), д.б.н. Ильясов Р.А. (ИБГ УНЦ РАН), асп. Шафикова В.М.)

  1. Разработка фитопрепаратов для профилактики и лечения инфекционных и инвазионных болезней пчелиной семьи как основы для производства экологически чистой продукции пчеловодства. Препараты создаются в качестве альтернативы средствам, полученным путем химического синтеза.

  2. Наиболее значимые результаты: В настоящее время разработан и начат промышленный выпуск жидкого концентрата «Фитоаск». Получен патент на изобретение № 2552672 «Состав для стимуляции развития пчелиных семей, профилактики и лечения аскосфероза». В его основе сбор лекарственных растений, имеющий фунгицидные свойства по отношению к Ascosphaera apis L, обладающий стимулирующим действием на весеннее развитие и улучшающим зимовку пчелиных семей.

 

Методы исследования

  1. Методы учета и оценки медоносных ресурсов

  2. Кадастровая оценка медоносных ресурсов территории

  3. Методы определения нектаро- и пыльцепродуктивности территории

  4. Методы клонального микроразмножения растений

  5. Молекулярный анализ проводится с помощью метода полимеразной цепной реакции.

  6. Бактериологические методы исследования возбудителей инфекционных заболеваний пчел.

 

Монографии и учебные пособия

  1. Фархутдинов Р.Г., Туктаров В.Р., Ишемгулов А.М. Медоносные ресурсы: практикум. Уфа, БГАУ, 2010, - 100 с.

  2. Туктаров В.Р., Фархутдинов Р.Г., Ишмеева З.Б., Янбаев Ю.А. Методология фундаментальных исследований популяций Apis melliferaL. 1758. /отв. редактор В.Р. Туктаров/, Уфа, Башкирский ГАУ, 2012 . – 108 с.

  3. Фархутдинов Р.Г., Туктаров В.Р., Ишемгулов А.М. Медоносные ресурсы/Учебное пособие //Уфа, Башкирский ГАУ, 2013, 212 с.

  4. Туктаров В.Р., Фархутдинов Р.Г., Саттаров В. Н., Юмагужин Ф.Г., Шелехов Д.В. Туктарова Ю.В. Оценка породной принадлежности медоносных пчел Apis mellifera mellifera L. 1758. Уфа, Башкирский ГАУ, 2014. – 104 с.

  5. Туктарова Ю.В., Фархутдинов Р.Г. Миграция нетрофических компонентов по пищевой цепи Apis millifera L.. Saarbrucken, Lambert Academic Publishing, 2014. 106 p

  6. Варламов А.А., Хисамов Р.Р., Стафийчук И.Д., Фархутдинов Р.Г. Кадастр медоносных ресурсов. Монография под науч. ред. А.А. Варламова. – М.: ФОРУМ 2016, - 400 с.

 

Статьи

  1. Туктарова Ю.В., Фархутдинов Р.Г.. К вопросу о содержании тяжелых металлов в продуктах пчеловодства. Аграрная Россия 2009, специальный выпуск, С. 204-205.

  2. Туктарова Ю.В., Фархутдинов Р.Г. Автомобильное загрязнение и продукция пчел. Пчеловодство. 2010, № 4, с. 10-11.

  3. Фархутдинов Р.Г.. Кудоярова Г.Р., Туктарова Ю.В., Веселов С.Ю. Твердофазный иммуноферментный анализ содержания фитогормонов в нектаре, пыльце и в мёде //Вестник Башкирского государственного аграрного университета. 2010, № 4 (16) С. 9-14.

  4. Туктарова Ю.В., Фархутдинов Р.Г Экологическая оценка миграций веществ в трофической цепи «почва - растение - пчела - мёд». Вестник Башкирского государственного аграрного университета. 2012. № 4. С. 58-60

  5. Ишемгулов А.М., Фархутдинов Р.Г., Хисамов Р.Р., Юмагужин Ф.Г., Ташбулатов Р.К., Хасанов Ф.Р. Оценка кормовой базы заказника «Алтын солок» как основа для сохранения и размножения башкирской бортевой пчелы. Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2013. № 1. С. 236-239.

  6. Туктарова Ю.В. Фархутинов Р.Г. Особенности миграции спор Ascosphaera apis на территории продуктивного лета пчел. Проблема ветеринарной санитарии, гигиены и экологии. 2013, № 1 (9), С. 55-58

  7. Туктарова Ю.В., Фархутдинов Р.Г. Биоаккумуляция тяжелых металлов в трофической цепи почва-растение-пчела-мед. Агрохимия. 2013, № 6, С. 78-82.

  8. Фархутдинов Р.Г., Туктарова Ю.В. Фитогормоны и продукты пчел. Пчеловодство № 5. - 2013. - С. 58-60.

  9. Туктарова Ю.В. Фархутдинов Р.Г., Оценка генетической дифференциации пчел, находящихся в различных условиях автотранспортного загрязнения. Вестник Башкирского государственного аграрного университета. 2013, № 2, С 65-68

  10. Фархутдинов Р.Г., Хисамов Р.Р., Кулагин А.А., Юмагужин Ф.Г., Ташбулатов Р.К., Хасанов Ф.Р. Ресурсы медоносных растений заповедной горно-лесной зоны Республики Башкортостан. Аграрная Россия. 2013. № 10. С. 41-46.

  11. Шафикова В.М., Фархутдинов Р.Г. Изменение активности фермента каталазы и пероксидазы у пчелы медоносной Аpis millifera millifera при использовании фитопрепаратов Вестник Башкирского университета. 2013. Т. 18. № 4. С. 1085-1087.

  12. Хисамов Р.Р., Фархутдинов Р.Г., Хасанов Ф.Р. Мониторинг естественных медоносных ресурсов Бугульминско-Белебеевской возвышенности в пределах Республики Башкортостан. Фундаментальные исследования. 2014. – № 5 (часть 1) – с. 84-88

  13. Хисамов Р.Р., Фархутдинов Р.Г., Хасанов Ф.Р. Использование недревесных ресурсов леса на Бугульминско-Белебеевской возвышенности Башкортостана. Известия Оренбургского аграрного университета. 2014, № 2 (46), С. 12-14

  14. Хисамов Р.Р., Фархутдинов Р.Г., Ташбулатов Р.К., Кулагин А.А. Кадастровая оценка медоносных ресурсов горно-лесной зоны Республики Башкортостан //Вестник Удмуртского университета, – 2014. – Серия 6, выпуск 2. –С. 41-49

  15. Фархутдинов Р.Г., Ильясов Р.А., Юмагужин Ф.Г., Туктарова Ю.В., Шафикова В.М., Абдуллин М.Ф. Фунгицид и стимулятор пчелиной семьи растительного происхождения. // Пчеловодство. - 2014. № 9. С. 33-35.

  16. Фархутдинов Р.Г., Ильясов Р.А., Юмагужин Ф.Г., Туктарова Ю.В., Шафикова В.М., Абдуллин М.Ф. Биологический стимулятор продуктивности пчелиной семьи с фунгицидной активностью. Биомика, 2014. Т. 6, № 2. С. 68-72.

  17. Ilyasov R.A., Farkhutdinov R.G., Shareeva Z.V. Influence of acaricides amitraz and fluvalinate on average daily egg and total honey productivity of honey bee colonies. Biomics. 2014, V. 6 (2). P. 73-76.

  18. Фархутдинов Р.Г., Хисамов Р.Р., Онучин М.С. Анализ состояния естественных медоносных ресурсов в районе широколиственных лесов Уфимского плато. Известия Самарского научного центра Российской академии наук. 2014. Т. 16. № 5-5. С. 1802-1807.

  19. Ишбирдина Л.М., Фархутдинов Р.Г., Хисамов Р.Р., Онучин М.С. Рекогносцировочное изучение травянистых сообществ северо-востока Башкортостана как потенциальной базы для развития лесного пчеловодства. Фундаментальные исследования. 2015. № 2-9. С. 1891-1896.

  20. Р.Р. Хисамов, Р.Г. Фархутдинов, М.С. Онучин Оценка состава нектароносных растений в зоне широколиственных лесов Уфимского плато и перспективы их рационального использования в пчеловодстве. Вестник БГАУ 2015, № 3, С 106 – 112

  21. Абдулгазина Н.М., Фархутдинов Р.Г., Юмагужин Ф.Г., Веселов Д.С. Сравнительный анализ содержания фитогормонов в нектаре и меде, собранном разными породами пчел. Современные проблемы науки и образования 2015. – № 2; URL: http://www.science-education.ru/122-17749 (дата обращения: 11.03.2015).

  22. Фархутдинов Р.Г., Юмагужин Ф.Г., Хисамов Р.Р. Нектароносные ресурсы заказника «Алтын Солок» и перспективы расширения ареала бурзянской бортевой темной лесной пчелы. Глава в монографии «Темная лесная пчела Apis mellifera mellifera L. Республики Башкортостан» / отв. ред. Ильясов Р.А., Николенко А.Г., Сайфуллина Н.М. Уфа: Гилем, Башк. Энцикл; 2015 С. 40-46.

  23. Фархутдинов Р.Г., Туктарова Ю.В. Оценка содержания фитогормонов в нектаре, пыльце и меде темной лесной пчелы башкирской популяции. Глава в монографии «Темная лесная пчела Apis mellifera mellifera L. Республики Башкортостан» / отв. ред. Ильясов Р.А., Николенко А.Г., Сайфуллина Н.М. Уфа: Гилем, Башк. Энцикл; 2015 С. 47-60.

  24. Фархутдинов Р.Г., Ильясов Р.А., Юмагужин Ф.Г., Уразбахтина Н.А., Туктарова Ю.В., Шафикова В.М., Абдуллин М.Ф. Применение фитосбора для лечения аскосфероза темной лесной пчелы башкирской популяции. Глава в монографии «Темная лесная пчела Apismellifera mellifera L. Республики Башкортостан» / отв. ред. Ильясов Р.А., Николенко А.Г., Сайфуллина Н.М. Уфа: Гилем, Башк. Энцикл; 2015 С. 163-176.

  25. Ilyasov R.A., Farkhutdinov R.G. Herbal Dietary Supplement with Antifungal Effect for Increasing the Productivity of Honey Bee Colonies. Chapter 2. In: Honeybees: biology, behavior and benefits, Editor: Daniaele Dreesen. Hauppauge, New York: Nova Science Publishers, Inc., 2016. P. 15-22.

  26. Фархутдинов Р.Г., Юмагужин Ф.Г., Ильясов Р.А., Шафикова В.М. Уразбахтина Н.А. Фитоаск – высокое качество зимовки семей, их весеннего развития и профилактика аскосфероза. Пчеловодство. 2016, № 6, С 29 – 32.

 

Патенты

  1. Фархутдинов Р.Г., Туктарова Ю.В., Ильясов Р.А., Иванов А.А., Воронков Ю.П., Шафикова В.М. Состав для стимуляции развития пчелиных семей, профилактики и лечения аскосфероза. Патент на изобретение № 2552672 от 12.05.2015

  2. Юмагужин Г. Г., Юмагужин Ф.Г., Абдулгазина Н.М., Габитов И.И., Янбаев Ю.А., Фархутдинов Р.Г. Способ получения медового напитка брожения (медовухи). Патент на изобретение № 2553381 от 18.05.2015

 

Диссертационные работы

  1. Туктарова Ю.В. Миграция нетрофических компонентов по пищевой цепи пчелы медоносной Аpis mellifera mellifera L. Уфа – 2013

  2. Ташбулатов Р.К. Состояние и перспективы использования естественных медоносных ресурсов горно-лесной зоны Республики Башкортостан. Оренбург 2013

  3. Хасанов Ф.Р. Состояние и перспективы рационального использования лесной флоры Бугульминско-белебеевской возвышенности в пределах Республики Башкортостан. Оренбург 2014

 

 

 

Лаборатория экспериментальной биоэнергетики растений

проф., д.б.н. Фархутдинов Р.Г.,

доц., к.б.н. Федяев В.В.,

магистрант 2 года обучения Шарапова З.,

магистрант 1 года обучения Абдулгужина Ф.,

студент 4 курса Хуснутдинов Э.

 

Биоэнергетика адаптации растений (доц. Федяев В.В., магистрант Абдулгужина Ф.)

Изучаются изменения процессов фотосинтеза и дыхания в связи с адаптацией растений к различным абиотическим стрессам

Наиболее значимые результаты:

Установлен ряд особенностей энергетического обмена у растений, обладающих различным уровнем адаптации к стрессам

Исследовано изменение структуры суперкомплексов электрон-транспортной цепи митохондрий растений в неблагоприятных условиях

Изучено влияние некоторых регуляторов роста на функционирование альтернативных путей дыхательного обмена

 

Влияние синтетических регуляторов устойчивости на адаптацию и продуктивность растений (проф., д.б.н. Фархутдинов Р.Г., доц. Федяев В.В., магистрант Шарапова З., студент Хуснутдинов Э.)

Проводятся испытания влияния новых синтетических регуляторов устойчивости на рост, редокс-метаболизм, энергетический обмен и продуктивность растений.

Наиболее значимые результаты:

Изучено влияние ряда новых регуляторов устойчивости растений на окислительно-восстановительный обмен и продуктивность растений

Определены оптимальные концентрации соединений для повышения устойчивости растений к абиотическим стрессам.

Исследуется влияние препаратов коллоидной серы на редокс-метаболизм и стресс-устойчивость растений.

 

Разработка систем бессубстратного выращивания растений (доц. Федяев В.В.)

Разрабатываются способы выращивания растений методами аэро- и гидропоники для оптимизации изучения архитектуры и метаболизма корневой системы растений и повышения эффективности испытаний регуляторов роста и устойчивости.

Наиболее значимые результаты. Получены государственные патенты на изобретения систем выращивания растений

 

Методы и оборудование

Изучение дыхательного газообмена проводится матометрическим методом на аппарате Варбурга и полярографически (полярограф «Эконикс-эксперт-001»)

Содержание тяжелых металлов в растениях и почве определяется методом полярографии (прибор Экотест-ВА)

Фотометрические измерения проводятся с помощью спектрофотометра Leki SS2107

 

Статьи

  1. Ramírez-Aguilar S.J., Keuthe M., Rocha M., Fedyaev V.V., Kramp K., Gupta K.J., Schulze W.X., Van Dongen J.T., Rasmusson A.G. The composition of plant mitochondrial supercomplexes changes with oxygen availability // Journal of Biological Chemistry. 2011. Т. 286. № 50. С. 43045-43053.

  1. Безрукова М.В., Фатхутдинова Р.А., Лубянова А.Р., Мурзабаев А.Р., Федяев В.В., Шакирова Ф.М. Участие лектина в формировании устойчивости пшеницы к токсическому действию кадмия // Физиология растений. 2011. Т. 58. № 6. С. 907-914.

  1. Дмитрюкова М.Ю., Баймиев А.Х., Федяев В.В., Рахманкулова З.Ф. Влияние экспрессии гена леггемоглобина а сои на рост, дыхание и антиоксидантное состояние растений табака в условиях повреждающего действия кадмия // Физиология растений. 2011. Т. 58. № 6. С. 915-921.

  1. Дмитрюкова М.Ю., Баймиев А.Х., Федяев В.В., Рахманкулова З.Ф. Изучение влияния экспрессии гена леггемоглобина а сои на устойчивость рапса к кадмию с использованием «бородатых» корней в качестве модельной системы // Вестник Башкирского университета. 2011. Т. 16. № 3. С. 698-701.

  1. Шуйская Е.В., Рахманкулова З.Ф., Биктимерова Г.Я., Щербаков А.В., Федяев В.В., Суюндуков Я.Т., Усманов И.Ю. Эколого-физиологический анализ представителей сем. CHENOPODIACEAE на засоленных почвах Южного Урала // Растительные ресурсы. 2014. Т. 50. № 4. С. 614-626.

  1. Рахманкулова З.Ф., Шуйская Е.В., Щербаков А.В., Федяев В.В., Биктимерова Г.Я., Хафизова Р.Р., Усманов И.Ю. Содержание пролина и флавоноидов в побегах галофитов, произрастающих на территории Южного Урала // Физиология растений. 2015. Т. 62. № 1. С. 79 – 85

 

Патенты

  1. Федяев В.В. Универсальная ячейка для электрохимического анализа физиолого-биохимических параметров животных и растений. Патент на полезную модель. 2015. RU 153450 U1

  2. Федяев В.В., J.T. van Dongen. Устройство для выращивания и научных исследований растений Arabidopsis thaliana L. методом гидропоники. Патент на изобретение. 2016. RU 2597859 C2

  3. Федяев В.В., Веселов С.Ю. Устройство для выращивания растений, семян и проростков. Патент на полезную модель. 2017. RU 173431 U1